본 발명은 항균 목재 소재의 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게 금속 나노입자가 코팅된 목재 소재 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명은 제1금속 전구체를 목재 소재에 노출시키는 제1단계, 목재 소재에 코팅된 상기 제1금속 전구체를 금속 입자로 전환시켜 금속 입자로 코팅된 목재 소재를 제조하는 제2단계, 제2금속 전구체를 상기 금속 입자로 코팅된 목재 소재에 원자층 증착하는 제3단계 및 상기 제2금속 전구체가 원자층 증착된 목재 소재에 반응가스를 도입하는 제4단계를 포함하는 항균 목재 소재의 제조 방법에 관한 것이다.